Aujourd'hui, ce même port naturel sert de point de départ principal pour l'exploration maritime récréative des 159 kilomètres de côtes de Samos, où des falaises de calcaire plongent dans une eau atteignant 24 °C en été et dont la visibilité dépasse quinze mètres lors des matins calmes. Le port lui-même est reconnu par l'UNESCO comme faisant partie de l'ensemble archéologique de Pythagorion, sa jetée antique étant toujours visible sous les quais modernes où s'amarrent les caïques en bois et les navires de plaisance en fibre de verre entre avril et octobre.
Les excursions en bateau à Samos parcourent un littoral sculpté par le soulèvement tectonique et des millénaires d'érosion marine, révélant une géologie qui reflète la position de l'île à la limite de collision entre les plaques africaine et eurasienne. Le rivage nord présente des escarpements abrupts s'élevant à 400 mètres directement au-dessus de la mer, accessibles uniquement par l'eau, tandis que la côte sud se déploie en une série de criques de sable et de galets séparées par des promontoires de marbre crétacé. L'îlot de Tsopela se trouve à trois milles marins au sud-est, site de nidification protégé pour les faucons d'Éléonore que les opérateurs contournent à une distance réglementaire pendant la saison de reproduction. Samiopoula, l'îlot inhabité situé à sept kilomètres au large, présente une plage en croissant unique où les capitaines jettent l'ancre pour des pauses baignade, la profondeur de l'eau passant de deux à douze mètres en l'espace de trente mètres depuis le rivage.
Les opérateurs au départ de Pythagorio proposent trois modèles d'itinéraires principaux : des boucles d'une demi-journée vers les criques du sud, incluant Psili Ammos et Mikro Seitani ; des tours complets avec escales déjeuner dans des tavernes côtières accessibles uniquement par la mer ; et des croisières au coucher du soleil qui permettent d'arriver aux falaises ouest pour la lumière estivale de 20h30. Les types de navires vont des caïques traditionnels de douze passagers avec moteurs diesel et auvents en toile aux catamarans modernes pouvant accueillir quarante personnes avec service de bar à bord et plateformes de baignade hydrauliques. Plusieurs capitaines détiennent des permis de pêche et proposent des expériences combinées croisière et pêche, traînant des lignes pour la bonite et le maquereau de Méditerranée pendant les trajets. Le littoral turc est visible à six kilomètres à l'est à travers le détroit de Mycale, bien que les frontières maritimes internationales restreignent les traversées récréatives sans dédouanement préalable.
Le front de mer commercial de Pythagorio s'étend sur 280 mètres de quai continu, divisé en postes d'amarrage numérotés où les tour-opérateurs maintiennent des positions assignées tout au long de la saison. Les départs matinaux se concentrent entre 09h00 et 10h00 pour exploiter la période précédant les vents de meltemi de midi qui accélèrent l'état de la mer, la plupart des navires revenant entre 16h00 et 18h00 lorsque les brises thermiques de l'après-midi diminuent. L'entrée du port nécessite de naviguer au-delà des vestiges submergés de l'ancien brise-lames de Polycrate, visibles sous forme de ligne sombre sous la surface à marée basse, un passage que les capitaines locaux exécutent sans instrumentation après des décennies de répétition.
8 h
